Insatserna har skett i provinserna Khyber Pakhtunkhwa i norr och Baluchistan i söder, vilka båda gränsar till Afghanistan.
Militären i Pakistan beskriver de dödade personerna som medlemmar i den pakistanska talibanrörelsen respektive separatistgrupper.
Den senaste tiden har våldet mellan regeringen och olika väpnade grupper trappats upp i landet. Pakistan anklagar Afghanistan för att ge en fristad åt grupperna och Indien för att ge stöd. Båda länderna nekar till anklagelserna.