Trump anklagar omröstningen för att vara ”betydelselös” och ha ”dålig tajming”, i ett inlägg på Truth Social.
Fyra republikaner röstade med Demokraterna i omröstningen, och de fyra kritiseras av Trump.
Initiativet, som fick grönt ljus i representanthuset tidigare i juni, kan inte stoppas men demokrater och republikaner har olika syn på huruvida det är juridiskt bindande eller av mer symbolisk karaktär.
Omröstningen skedde kort efter det att USA och Iran nått ett samförståndsavtal som syftar till att avsluta kriget som USA och Israel inledde mot Iran den 28 februari.