Händelsen beskrivs som en rutinmässig säkerhetskontroll på Indira Gandhi-flygplatsen i Indiens huvudstad New Delhi.
En säkerhetskontrollant upptäckte då ett misstänkt föremål i en av passagerarnas handbagage när det gick genom röntgen.
Vid närmare undersökning visade sig väskan innehålla en döskalle, rapporterar Times of India.
Indiens centrala industripolis, som bland annat sköter bevakningen av landets stora infrastrukturella punkter som flygplatser, har lagt upp en bild av kraniet på sitt X-konto.
Överlämnades till polisen
Personen, som var på väg från New Delhi till Hydarabad, greps och hävdade i förhör på flygplatsen att kraniet kom från en apa.
Händelsen utreds nu av polis och även Indiens motsvarighet till Naturvårdsverket som ska ta reda på hur kraniet kommit i personens ägo och ifall det rör sig om en kriminell liga som illegalt handlar med djur.
– Vi måste fastställa exakt var kraniet kommer ifrån, säger den lokala polisen i ett uttalande enligt The Tribune.
Indien har strikta djurskyddslagar sedan ett parlamentariskt beslut togs 1972.
Det är fortfarande inte bekräftat att skallen kommer från en apa och om passageraren gjort sig skyldig till någon brottslighet.