Iran kommer fortfarande att behöva lämna USA direkt efter fredagens match, säger en talesperson för departementet.
Inför de två första matcherna, i Los Angeles, fick laget inte tillåtelse att resa förrän dagen innan, vilket Iran har varit starkt kritiska till.
– Jag tror att det här kommer markera en mörk punkt i VM:s moderna historia, sade det iranska fotbollsförbundets generalsekreterare Hedayat Mombeini efter VM-premiären mot Nya Zeeland (2–2).
Irans avslutande gruppspelsmatch mot Egypten har avspark klockan 05.00, svensk tid, på lördag.