Erkännandet kom i en federal domstol på Manhattan där han sade sig vara beredd att erkänna att han stalkat försäkringsbolags-vd:n.
– Jag sköt Mr Thompson och han dog. Jag visste att det jag gjorde inte var lagligt, sade Mangione enligt CNN.
Den 28-årige Mangione står åtalad i såväl federal som delstatlig domstol och hans advokater väntas hävda att erkännandet att stalkningen ledde till dödsfallet ska förhindra den delstatliga rättegången om mord som är planerad att inledas i september.
Dom i den federala rättegången väntas i december.
Mordet på försäkringsbolagets vd utanför ett hotell på Manhattan i december 2024 har fått stor uppmärksamhet.