I Jyväskylä i mellersta Finland skulle fransmannen köra den näst sista specialsträckan och hade ledningen.
Men Ogier tappade kontrollen över bilen som körde in i skogen och voltade flera gånger i hög fart.
Enligt Yles radio på plats så landade en räddningshelikopter på platsen. Kartläsaren Julien Ingrassia ska må bra, medan Ogier behöver läkarvård, enligt uppgifterna.
Toyotas rallyteam meddelade på X att Ogier och Ingrassia har kunnat lämna bilen.
Ogier ledde VM:et med 20,9 sekunder före Sami Pajari.
Texten uppdateras.