Överlämnandet ägde rum sent på onsdagen under ett möte mellan FBI-chefen Kash Patel och president Prabowo Subianto i hans residens i Indonesiens huvudstad Jakarta.
Föremålen, som bland annat tillhör Dani- och Asmatfolken, har smugglats illegalt till USA via internationella nätverk för antikviteter, uppger USA:s ambassad i Jakarta i ett uttalande.
Kulturföremålen – däribland ceremoniella objekt och stenyxhuvuden – kommer nu att ställas ut på Indonesiens nationalmuseum, skriver AP.