Ett sista försök att stoppa godkännandet röstades ned på torsdagen då stoppsidan endast fick med sig 276 ledamöter – ett 80-tal färre än vad som krävdes.
Ett mindre antal ändringar i lagtexten godkändes ändå, vilket innebär att det sannolikt krävs förhandlingar med EU:s medlemsländer innan förlängningen kan spikas.
I praktiken innebär ändå beslutet en fortsättning för de gamla regler som löpte ut i våras.
Frågan om hur sökandet efter övergreppsmaterial ska få gå till har lett till en het debatt i flera år, med anklagelser om alltför stor insyn i privata chattar och e-post.