Det var på en presskonferens inför kvartsfinalen mot Frankrike som förbundskaptenen Mohamed Ouahbi meddelade att 25-åringen inte kommer finnas med i laget.
– Den här matchen kommer för tidigt för honom, sade han.
Det är fortfarande oklart hur allvarlig skadan är. Enligt Mohamed Ouahbi finns det förhoppningar om att Saibari kommer kunna spela en eventuell semifinal om Marocko tar sig dit.
Saibari gjorde tre mål i gruppspelet och satte den avgörande straffen mot Nederländerna i 16-delsfinalen.
Frankrike–Marocko börjar klockan 22.00.