Scenen kommer att plockas bort genom en uppdatering i november, rapporterar BBC.
Beskedet kommer sedan anhöriga till offer sagt sig vara ”förskräckta” över att verkliga nyhetsbilder – som bland annat visar täckta kroppar på gatan och livräddande insatser – används i en sekvens i spelet.
Katastrofen inträffade när panik uppstod i samband med ett halloweenfirande i Seoulstadsdelen Itaewon för fyra år sedan. Nära 160 människor klämdes eller kvävdes till döds.
”Att använda en sådan händelse i ett spel som är gjort för underhållning är i sig högst olämpligt”, skriver familjerna i ett uttalande enligt BBC.
”Call of duty: Modern warfare 4” skildrar en fiktiv nordkoreansk invasion av Sydkorea.
Utgivaren Activision ber om ursäkt och säger att syftet aldrig var att ”trivialisera” trängselkatastrofen.