Larmet inkom vid 21-tiden under fredagskvällen, men på grund av den branta vägen uppför berget nådde den lokala räddningstjänsten fram till toppen av alpen ovanför Berchtesgaden först 21.52.
En talesperson för den lokala polisen säger nu till Bild att skadorna på byggnaden är omfattande.
– Det är osannolikt att huset går att rädda.
Polisen har gripit en man som de misstänker har anlagt branden, men myndigheterna ville på lördagsmorgonen inte lämna några uppgifter om den gripnes identitet, eller om det finns några konkreta bevis mot honom. Utredarna har inte heller lämnat några uppgifter om ett eventuellt motiv.
Kehlsteinhaus heter byggnaden, som ligger på 1 834 meters höjd i Obersalzberg vid gränsen mot Österrike och är ett populärt turistmål.
Huset byggdes 1938 som ett ”tehus” för Adolf Hitler på uppdrag av nazistledaren Martin Bormann, men Hitler besökte sällan Kehlsteinhaus. Han föredrog att stanna längre ned på berget, i jättekomplexet Berghof som fungerade som nazisternas andra regeringshögkvarter.