Enligt Al-Shifa-sjukhuset i Gaza stad, som vid gryningen tog emot fem kroppar och ett antal skadade, var de dödade två kvinnor och deras döttrar samt en ung man.
Israels militär riktade in sig på Ali al-Amoudi, en högt uppsatt Hamas-företrädare, rapporterar israeliska medier. Militären har ännu inte kommenterat händelsen.
Israeliska styrkor har dödat mer än 1 440 personer på Gazaremsan sedan vapenvilan inleddes i oktober förra året, enligt Gazas hälsodepartement, som står under Hamas ledning och vars siffror anses tillförlitliga av FN.