Upptäckten av öarna kommer efter förra månadens omfattande utbrott i Anak Krakatau.
Enligt myndigheten PVMBG upptäcktes öarna på satellitbilder av en vattenfylld kaldera där vulkanen ligger.
Anak Krakatau ligger i Sundasundet, mellan de indonesiska öarna Sumatra och Java, och bildades själv i samband med ett jätteutbrott i den ursprungliga vulkanen Krakatau 1883. ”Anak” betyder barn på indonesiska.
Utbrottet i september varade i 25 timmar och fick flygtrafiken i området att stå stilla i flera dygn. Fortfarande saknas fem journalister som begav sig av mot vulkanen i samband med utbrottet.