Det var efter en spark i knähöjd från nederländaren Quinten Timber som Havertz tvingades avbryta torsdagskvällens möte i Amsterdam.
Anfallaren skulle senare under kvällen genomgå en magnetkameraundersökning, vilket även gällde landslagskamraten Jamal Musiala.
– Jag hoppas att det inte är något allvarligt. Killarna är förmodligen borta för oss. Men förhoppningsvis är de tillbaka i spel relativt snabbt, sade den nye förbundskaptenen Jürgen Klopp till RTL, enligt Sky Sports.
På fredagen meddelade det tyska förbundet att duon lämnar samlingen.
Havertz har startat samtliga fem Premier League-matcher för Arsenal denna säsong samtidigt som Viktor Gyökeres varit bänkad i tre och endast fått göra korta inhopp i övriga två.