Drönaren upptäcktes strax efter midnatt, lokal tid, och sköts av ned av Nato-stridsplan över centrala Litauen.
Enligt myndigheten för landets för krishantering bar drönaren ”högst sannolikt” en explosiv laddning.
”Tillsammans med våra Natoallierade kommer Litauen att försvara sitt luftrum”, skriver Litauens president Gitanas Nausėda på X.
Ursula von der Leyen pekar ut Ryssland för att ligga bakom när hon i sitt inlägg om båda incidenterna på X skriver:
”Europa har återigen väckts av hänsynslöst och farligt ryskt agerande. Vi ökar pressen på Ryssland”.
EU:s utrikeschef Kaja Kallas menar att unionen måste skärpa åtgärderna riktade mot Kreml:
– Däribland att se över utfärdandet av turistvisum till ryssar, för att motverka Moskvas hybridattacker. Vi måste minska antalet personer som utför attacker på europeisk mark, säger Kallas.