De har lämnat landet efter tilltagande strider mellan de Iranstödda huthierna och jemenitiska regeringsstyrkor som stöds av Saudiarabien.
Tiotusentals har flytt efter de senaste dagarnas offensiv, som kulminerade när Huthirörelsen intog stora delar av Jemens kust mot Röda havet, vilket befäste dess kontroll över sundet Bab al-Mandab.
”Mer än 2 000 personer som flyr striderna i Jemen har anlänt till Djiboutis kust”, skriver Internationella organisationen för migration (IOM) på X på söndagen.
Djibouti ligger mittemot Jemen på andra sidan sundet och har blivit en viktig led för saudisk oljeexport efter att Iran inledde en blockad av Hormuzsundet. Det är också en vanlig genomfartsplats för migranter som hoppas att nå länderna vid Persiska viken.